Метка «ZINBA»

Биоинформатика / Установка и первичная настройка ZINBA

    Заметил, что статьи получаются довольно большими, и вопросы задаются в разных направлениях. Эта статья была написана для того, чтобы собрать вопросы по установке программы ZINBA в отдельной теме. Итак, для работы с ZINBA нужно знать, как ее установить.
    Подробная инсталляция расписана на сайте разработчика на английском языке. Поэтому далее я кратко опишу необходимые этапы на русском. Все шаги выполнялись мною в ОС OpenSUSE 12.1 x64, но должны проходить без эксцессов и на других Linux платформах. Запускаем R (если есть вопросы по настройке, обсудим в комментариях ), выполняем следующие команды:

system(«wgetЧитать полностью »

Биоинформатика / Практическая биоинформатика ч.4. Готовимся работать с ZINBA
    В современном мире анализа данных использовать только один метод или только один подход означает, что рано или поздно ты столкнешься с фактом, как сильно ты ошибался. Для анализа данных комбинируют различные методики, сравнивают результат и на основании сравнения уже делают более точные прогнозы. В программе ZINBA использован именно такой подход. Разработчики объединили разнообразные методы анализа DNA-seq экспериментов в едином пакете. Этот пакет написан для программы статистической обработки данных R. Что же делает ZINBA? Находит различные обогащенные регионы даже в тех случаях, когда некоторые из них были усилены, например, химическиЧитать полностью »


https://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/3.4.1/jquery.min.js