Рубрика «безумный ученый»

Мы решили применить наш математический аппарат, описывающий нелинейную динамическую среду, к фолдингу белка. В основе метода лежит гипотеза о реологической матрице среды. Мы не подбираем структуру перебором, а вычисляем её как топологический отклик цепочки на физические параметры среды. Полученные в результате расчёта последовательности были загружены в AlfaFold server, Blast и Foldseek Search Server. Поскольку ранее мы не сталкивались с работой в подобных программах, и изыскание было междисциплинарным, на освоение было очень мало времени, около недели, поэтому наши знания и навыки работы в данных средах весьма поверхностны.

Читать полностью »