Рубрика «биоинформатика»

в 6:25, , рубрики: биоинформатика

Вы когда-нибудь задумывались, сколько тайн скрыто в миллиардах генетических последовательностей, данных о белках и эпигенетических механизмах? А теперь представьте, как алгоритмы преобразуют этот хаос в логичные и работающие модели.

Не так давно алгоритмы в биоинформатике собирались вручную. Сегодня, благодаря машинному обучению, они адаптируются, обучаясь на предоставленных данных, вычленяют низкоуровневые закономерности и формируют абстрактные представления.

Главные направления биоинформатики

Задачи, которые стоят перед биоинформатикой, можно разделить на три основные категории:

в 10:42, , рубрики: c-Myc, IPSC, Klf4, Oct4, sens, Sox2, биоинформатика, Биотехнологии, генетика, молекулярная биология

Они называли их сумасшедшими. Шарлатанами. Еретиками, посягнувшими на божественный порядок вещей.

В 2005 году журнал MIT Technology Review предложил $20,000 любому, кто сможет опровергнуть подход британского программиста-самоучки к победе над старением. Премию так никто и не получил. Это стало первым звонком: что-то в мире науки необратимо изменилось.

Сегодня, в 2025 году, компании с суммарным финансированием в $10 миллиардов штурмуют последний рубеж человечества. Смерть больше не судьба. Она стала инженерной проблемой.

Программист, взломавший код старения

Читать полностью »

в 6:10, , рубрики: BERT, биоинформатика, трансформеры, ферменты, энзимы

Глубокое обучение гламурно и ажиотажно. Если обучить трансформер (современную языковую модель) на датасете из 22 миллионов ферментов, а затем использовать его для прогнозирования функции 450 неизвестных ферментов, то можно опубликовать свои результаты Nature Communications (уважаемом научном издании). Вашу статью прочитают 22 тысяч раз и она будет в верхних 5% из всех результатов исследований по оценке Altmetric (рейтингу внимания к онлайн-статьям).

Читать полностью »

в 11:57, , рубрики: бактерии, биоинформатика, биохимия, графы, медицина, оксилипины, патогены, растения, статистика, филогенетика

Мы нашли некоторые биоинформатические свидетельства того, что фермент липоксигеназа и оксилипиновая сигнализация позволяют бактериям «перепрыгивать» между растениями и человеком. Чтобы подтвердить нашу гипотезу, я провел дата-исследование. Здесь я объясняю, почему я решил оставить эту статью препринтом, не опубликованным официально.

В 2020 году мы с соавторами опубликовали биоинформатическое исследование [1]Читать полностью »

в 8:15, , рубрики: анализ данных, биоинформатика, генетика, код, молекулярная биология, транскриптом

Все знают, что наследственная информация закодирована в ДНК. Но мало кто задумывается о том, как эта информация реализуется внутри нас. Как информация с одних молекул передается на другие? Что качественное и количественное соотношение генов в данный момент может сказать о состоянии нашего организма? Сейчас попробуем разобраться, как считают гены, и что это дает.

Читать полностью »

в 9:40, , рубрики: Алгоритмы, алгоритмы сортировки, биоинформатика, биоинформатические алгоритмы, биология, гены
Как посчитать биологические данные и не уронить сервер и ноутбук? - 1

Привет, Хабр


Наверняка вы слышали о биоинформатике. Звучит перспективно, приятно и полезно. Часто, ввиду всеобщих рассказов о перспективности и возможностях направления, некоторые люди из IT или из «мокрой» биологии (так называют область биологии, где работают в лаборатории с бактериями и прочими возможными объектами живой и не очень природы и реагентами) хотят перейти в биоинформатику. Однако далеко не все понимают, что же это за область такая и почему с ней сложно работать.Читать полностью »

в 17:19, , рубрики: биоинженерия, биоинформатика, биоинформатические алгоритмы, биология, генетика, генная инженерия, генная терапия, неизлечимые болезни, онкология, рак

Итак, дорогие читатели! Сейчас я обучаюсь на 4 курсе (бакалавр) на программиста (направление: Информатика и вычислительная техника) в семестре столкнулся с очень интересным исследовательским проектом, связанным с биоинформатикой! Вместе с заказчиком мы ему дали научное название: "Снижение рисков развития рецидива злокачественного новообразования" и отправляем в долгое плавание!

Читать полностью »

в 10:55, , рубрики: анализ данных, биоинформатика, биология, биотех, Биотехнологии, генетика, генетические алгоритмы, машинное обучение, машинное обучение. нейросети python, Модель данных

Давайте представим, что вы начинающий или опытный биоинформатик, или "простой смертный", который хочет углубиться в анализ биологических данных. Спойлер: биоинформатики тоже смертные! Зачастую, не у каждого хватает ценного времени на проверку огромных последовательностей геномных данных, будь то поиск различных мутаций или прогнозирование структуры белков на основе последовательности аминокислот.

Но не переживайте, в этом вам поможет искусственный интеллектЧитать полностью »

в 18:44, , рубрики: анализ данных, биоинформатика, биология, Биотехнологии, биохакинг, генетика, гены, днк, машинное обучение, РНК

В современном мире каждый из нас сталкивается с генетикой, будь то медицинские анализы, CRISPR-дизайн или изучение наследственных признаков. Но что, если мы могли бы заглянуть глубже, понять тайные механизмы генов и даже создать новые последовательности ДНК, пригодные для науки и медицины? Это больше не фантазия, а реальность благодаря Evo — искусственной нейросети, которая переосмысливает подходы к анализу и проектированию геномов.

Что такое Evo?

Читать полностью »

в 11:14, , рубрики: python, биоинформатика, биология, биотех, генетика, днк, примеры кода, транскрипция, эпигенетика

Мир биоинформатики полон загадок: что такое избыточная ДНК, почему она занимает половину генома, и как это вообще работает? Кому-то может показаться, что некодирующая ДНК — это просто лишний "хлам", но на деле это, как если бы в вашем коде было полно комментариев, которые точно знают, как заставить ваш Python работать быстрее.

Сегодня мы с вами разберёмся, как эта загадочная избыточная ДНК умудряется контролировать экспрессию генов, совершенно ничего не транскрибируя. А чтобы вы не скучали, покажу примерчик на Python. Ведь кто же мы без кода?

Избыточная ДНК: что это такое?

Читать полностью »

123...10...17
Главная   |  Архив новостей  |   Android  |   Google  |   Apple  |   Microsoft  |   Информационная безопасность  |   Веб – разработка
Публикации RSS  |  Комментарии RSS
https://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/3.4.1/jquery.min.js