В современном мире каждый из нас сталкивается с генетикой, будь то медицинские анализы, CRISPR-дизайн или изучение наследственных признаков. Но что, если мы могли бы заглянуть глубже, понять тайные механизмы генов и даже создать новые последовательности ДНК, пригодные для науки и медицины? Это больше не фантазия, а реальность благодаря Evo — искусственной нейросети, которая переосмысливает подходы к анализу и проектированию геномов.
Рубрика «биоинформатика» - 2
Биоинформатика и Evo: как искусственный интеллект меняет подходы к анализу геномов
2024-12-07 в 18:44, admin, рубрики: анализ данных, биоинформатика, биология, Биотехнологии, биохакинг, генетика, гены, днк, машинное обучение, РНККогда «тихая» ДНК громче гена: как избыточная ДНК регулирует экспрессию, ничего не делая
2024-12-04 в 11:14, admin, рубрики: python, биоинформатика, биология, биотех, генетика, днк, примеры кода, транскрипция, эпигенетикаМир биоинформатики полон загадок: что такое избыточная ДНК, почему она занимает половину генома, и как это вообще работает? Кому-то может показаться, что некодирующая ДНК — это просто лишний "хлам", но на деле это, как если бы в вашем коде было полно комментариев, которые точно знают, как заставить ваш Python работать быстрее.
Сегодня мы с вами разберёмся, как эта загадочная избыточная ДНК умудряется контролировать экспрессию генов, совершенно ничего не транскрибируя. А чтобы вы не скучали, покажу примерчик на Python. Ведь кто же мы без кода?
Избыточная ДНК: что это такое?
Интегрируем pandas с электронными таблицами: три способа
2024-08-17 в 11:15, admin, рубрики: csv, Excel, google spreadsheets, pandas, pandas dataframe, python, биоинформатикаОткрываем и сохраняем файлы Excel в pandas
Pandas идеально подходит для работы с табличными данными – он способен открывать файлы Excel и проводить внутри преобразования. Более того, сохранить датафрейм тоже можно в файл Excel. Это делает удобной интеграцию pandas с офисным пакетом: результаты можно сразу красиво оформить для выступления на конференции или передачи коллегам, которые занимаются только “мокрой” биологией и не работают с инструментами data science.
Давайте посмотрим, как это делается. Если мы импортировали pandas под именем pd:
import pandas as pdто считать фрейм данных из файла Excel можно следующим образом:Читать полностью »
Может ли биолог починить радио? 20 лет спустя
2023-05-26 в 9:22, admin, рубрики: BioUML, SBGN, SBML, биоинформатика, биология, Биотехнологии, Блог компании Университет Сириус, визуальное моделирование, Научно-популярное, Университет Сириус
В 2002 в журнале Cancer Cell вышла весьма саркастическая статья Юрия Лазебника «Может ли биолог починить радиоприемник, или что я понял, изучая апоптоз».
За 20 лет много изменилось. Биологи создали графический язык SBGN (Systems Biology Graphical Notation) для представления структуры биохимических путей и XML формат SBML (Systems Biology Markup Language) для представления математических моделей.
Как подсчитать медведей с помощью термодинамики? Рецепт простой: много фотоловушек, две ложки компьютерного зрения и щеп
2022-11-25 в 8:00, admin, рубрики: Анализ и проектирование систем, биоинформатика, биология, Блог компании FirstVDS, животные, медведи, наука, Научно-популярное, физика, фотоловушки, Читальный зал
▎Привет!
В этой статье я хотел бы рассказать о том, как с помощью разных современных технологий и фишечек можно решить одну из злободневных проблем современной экологической науки – подсчет численности видов.
| Сразу предупреждаю, я не айтишник. Я зоолог-эколог. Поэтому, в отличие от других подобных статей про ИИ, нейросети и распознавание образов, в этой взгляд будет с точки зрения эколога и того, как мы понимаем данную проблему. И поскольку я изучаю бурых медведей, то речь, главным образом, пойдет про них. |
Почему я не хочу продолжать работу в биотехе
2022-09-03 в 21:53, admin, рубрики: биография, биоинженерия, биоинформатика, биология, Биотехнологии, Карьера в IT-индустрии(Ближе к сути - 3 Глава)
Глава 1. Если бы не реальность у меня все было бы хорошо
Биоинформатика — это наука или всё же метод?
2022-02-09 в 9:01, admin, рубрики: ruvds_статьи, Алгоритмы, алгоритмы обработки данных, алгоритмы поиска, биоинформатика, биология, Биотехнологии, Блог компании RUVDS.com, вычислительная биология, Научно-популярное
Про биоинформатику слышали многие. Кто-то знает больше, кто-то меньше. Мы постарались раскрыть вопрос этой, относительно новой, науки. Так сказать, дать общие представления читателю об основных вехах развития, методах и проблемах: решённых и существующих на нынешнее время.Читать полностью »
Как работает DeepMind AlphaFold2?
2022-01-08 в 18:50, admin, рубрики: AlphaFold2, DeepMind, биоинформатика, биология, Биотехнологии, машинное обучение, механизм внимания, нейронные сети, трансформеры, Фолдинг белков
Краткое знакомство с моделированием белков
2021-12-11 в 9:10, admin, рубрики: diy или сделай сам, timeweb_статьи_выходного_дня, Алгоритмы, базы данных, белки, библиотеки, биоинформатика, биология, Биотехнологии, Блог компании Timeweb Cloud, модели, моделирование, молекулы, Научно-популярное, Читальный залАвтор: нейрофизиолог научно-просветительского проекта Фанерозой, Анастасия Маркова.
Благодарность: искренне благодарим биоинформатика Жукову Алину Александровну (к.б.н., доцент кафедры анатомии и физиологии человека и животных РГПУ им. А.И. Герцена) за дельные советы, проверку статьи и помощь
Дисклеймер от мистера ДНК- очевидность
Данная статья будет интересна тем, кто хоть как-то знаком с молекулярной биологией и биохимией, а также интересуется возможностью визуализации белков.
Данная статья будет интересна тем, кто хоть как-то знаком с молекулярной биологией и биохимией, а также интересуется возможностью визуализации белков.
Наш мир полон разнообразия: повсюду встречаются различные виды растений и животных — повсюду кишит жизнь. И если так подумать, вспомнить школьные годы, то один из ученых, а именно Фридрих Энгельс когда-то дал свое особенное определение жизни, которое является одним из множества других:
“Жизнь есть способ существования белковых тел, существенным моментом которого является постоянный обмен веществ с окружающей их внешней природой, причем с прекращением этого обмена веществ прекращается и жизнь, что приводит к разложению белка”. Читать полностью »
Видео курсов Computer Science клуба
2021-01-05 в 14:22, admin, рубрики: Алгоритмы, биоинформатика, Биотехнологии, Блог компании Образовательные проекты JetBrains, курсы, математика, машинное обучение, языки программированияComputer Science клуб — это открытые лекции по компьютерным наукам в Санкт-Петербургском отделении Математического института РАН. Филиалы CS клуба действуют в Новосибирске и Казани. В связи с эпидемией все лекции осеннего семестра проходили онлайн и были доступны всем желающим вне зависимости от их местонахождения. Видеозаписи этих курсов выложены на сайт клуба и в канал на ютубе.