Сценарии заражения в конкретных городах на основе датасета передвижения людей по России

в 6:54, , рубрики: COVID-19, data mining, data science, ods, SARS, Блог компании Туту.ру, датасет потоков транспорта, Здоровье гика, коронавирус, математический прогноз, Россия

Сценарии заражения в конкретных городах на основе датасета передвижения людей по России - 1
Статистика для Москвы в сценарии «люди стараются сидеть по домам, нет авиасообщения» — к ноябрю модель показывает 5 миллионов переболевших. Это ограниченный прогноз на основе неполных данных, ниже будут детали. За ноль принято 22 марта.

В мире было создано несколько моделей распространения инфекции, но ни одна не подходила нормально для России, либо опиралась на плотность населения без правильного графа перемещений людей. Почему? Потому что либо он получается так сложно, что вы окосеете его согласовывать, либо его ни у кого в одном месте этого датасета просто нет.

Кроме нас.

Туту.ру с радостью делится данными с журналистами уже 16 лет (огромная часть новостей в духе «Заметен аномальный спрос на Анталию» — это нарезка наших информационных витрин). Но мы исторически никогда не раскрывали сами данные по перемещениям людей целыми блоками.

Мы собрали датасет передвижений людей по России за апрель 2019 и передали его в сообщество Open Data Science. Если вы их не знаете — это объединение преимущественно русских дата-сайнтистов (но со всего мира), которое перерабатывает открытые данные на полезные модели. Некоммерчески.

Ниже выводы, таблица с прогнозом по каждому крупному городу, сам датасет (если вы хотите попробовать с ним что-то сделать). Про то, как работает модель и какая математика и ограничения лежат внутри, расскажет ODS через пару часов. И выложит исходники.

Датасет

Это то, как люди путешествовали по стране за прошлый апрель-2019 (с некоторыми погрешностями). Датасет представляет собой набор векторов от города к городу (первый указанный город — откуда, второй — куда), вид транспорта и число пассажиров, восстановленное до 100%. Датасет представляет собой статистические обезличенные данные, касающиеся групп людей.

Вот визуализация сета. За неё ещё раз спасибо Safronov.

Ограничения данных: автобусы — самая неточная часть датасета. Мы не можем точно знать, сколько людей проехало на автобусах из-за так называемых «серых» перевозчиков, которых мы не поддерживаем на платформе. Но мы постарались восстановить эти данные по известным маршрутам. В авиа и железной дороге данные куда более точные, но не на 100%. Мы не видим перемещения военных, персонала железной дороги, детские вагоны и прочие необычные билеты. Есть ряд перевозок вроде вертолётных маршрутов между городами Дальнего Востока и винтомоторной авиация Якутии. В авиации наше покрытие рынка очень хорошо по всей европейской части России и падает к востоку (во Владивостоке, Новосибирске и Хабаровске данные наиболее точны в восточной части страны). На железнодорожных билетах погрешность довольно мала.

Если человек ехал в поезде Москва – Петербург и вышел в Твери, то он считается за пассажира Москва – Тверь.

Можно получить более точные данные через разных перевозчиков, ведомства и официальную статистику, но это почти невозможно на практике в короткие сроки. Наши данные достаточны для оценки, но просто помните, что они также собраны и восстановлены с некоторой погрешностью.

Забрать его можно вот тут. Через пару часов будет публикация о том, как работает модель и что у неё под капотом, и ODS раскроет исходники. Там будет репозиторий с уже уложенной этим датасетом и другими (вроде поставленной в соответствие карты городов по названиям с координатами и количеством заболевших).

Если что-то сделаете с ним — покажите, пожалуйста, в личку или в мою почту noreply@tutu.ru.

Сценарии

Есть три базовых сценария: «мы ничего не трогаем, всё идёт как обычно» — дальше всё предсказуемо плохо по уровню заражения. Второй сценарий — «мы перекрываем всё авиасообщение и люди стараются сидеть дома, но машины и поезда продолжают ездить». Третий сценарий — закрытие основных транспортных хабов. С учётом свежих изменений, мы посчитали первый (в CSV есть выводы), но взяли также выводы четвёртого, где смоделировали сокращение трафика по стране до 10% от обычного.

По той же ссылке CSV сценариев.

Мировое сообщество не первый раз встречается с эпидемиями и не первый раз прогнозирует их развитие с помощью матмоделей. Математика местами сложная, но нейросети нужны. Но моделирование потоков между вершинами графа математически очень близко к самым современным архитектурам нейросетей. Алгоритмы распространения эпидемии давно известны, нужно только задать параметры вроде контагиозности. Которые за нас подсчитали китайцы, итальянцы и остальные, кто столкнулся с проблемой ранее. Прошлый пост с кучей ссылок на исследования, верифицированный врачами, во многом был сбором начальных данных для модели. Тем не менее ещё раз предупреждаю: в модели используются не совсем точные исходные данные, среди разработчиков нет профессиональных эпидемиологов (но мы пользуемся их алгоритмами), модель имеет свои ограничения. Детали по SIR будут в посте ODS. Оценочная точность — до порядка.

Работа модели выглядит так:

  1. Считаем распространение болезни за день.
  2. Считаем, сколько людей переехало в другой город на основе взвешенных векторов перевозок.
  3. Пересчитываем количество инфицированных в городах.
  4. Запускаем следующий такт.

Шум в начале модели вызван тем, что отправная точка — 22 марта 2020, и она не учитывает тех, кто заразился где-то за рубежом до этого и никак себя не проявил до теста в последующие дни. Важно и то, что опорные данные модели — это не фактическое количество больных, а количество протестированных с положительным тестом на COVID-19. То есть переносчиков по факту может быть больше, и цикл заражения сократится. Заражения внутри транспорта пока не учитываются в модели.

Результаты

Показываю два расчётных экстремума — что будет, если ничего не делать (вариант 1) и принять максимум мер, но не включать режим тотального карантина с границами по кварталам (вариант 2).

Всё по той же ссылке CSV выгрузки, в формате таблицы ниже.

Сценарий 1: самый быстрый

Сценарий 1 — самый плохой с точки зрения распространения инфекции, когда сохраняется 100% трафика между городами (сейчас он уже ниже), а люди не стараются самоизолироваться, например, ездят на автобусах и в метро на вот такие ярмарки, но при этом соблюдают рекомендации по мытью рук и стараются соблюдать дистанцию (с переменным успехом). Моделируется полгода, поэтому, например, Москва не будет излечена до состояния «менее тысячи инфицированных одновременно» в рамках периода отработки модели.

Параметры колонок — количество одновременно инфицированных пациентов (выздоровевшие туда не входят). Первый порог начинается с «больше тысячи» (это день, когда в городе число одновременно инфицированных превышает тысячу), дальше 10 и 100 тысяч. Четвёртая колонка — момент, когда субъективно можно переставать прятаться, меньше 1000 одновременно инфицированных.

Город			>1000	>10.000	>100.000 <1000
Москва			13	25	38	-
Санкт-Петербург		23	33	45	-
Ижевск			28	40	57	-
Нижний Новгород		30	41	55	-
Ростов-на-Дону		30	41	56	-
Архангельск		32	44	-	172
Брянск			32	44	64	174
Воронеж			33	44	58	-
Ярославль		33	45	61	-
Сыктывкар		34	47	-	171
Пенза			35	47	64	-
Рязань			35	46	63	-
Тула			35	46	64	-
Симферополь (Крым)	36	48	-	178
Белгород		37	49	-	177
Иваново			37	49	-	-
Краснодар		37	48	63	-
Липецк			37	48	66	-
Саратов			37	48	63	-
Смоленск		37	49	-	175
Астрахань		38	49	67	-
Волгоград		38	48	62	-
Казань			38	48	63	-
Сочи			38	50	-	-
Ставрополь		38	50	-	-
Тамбов			38	50	-	171
Владимир		39	50	-	176
Калуга			39	51	-	174
Елец			40	54	-	152
Каменск-Шахтинский	40	54	-	149
Псков			40	52	-	165
Чебоксары		40	52	73	-
Алексин			41	59	-	140
Новгород Великий	41	53	-	167
Старый Оскол		41	53	-	165
Волгодонск		42	54	-	160
Вологда			42	53	-	174
Екатеринбург		42	54	71	-
Кострома		42	54	-	170
Курск			42	53	-	-
Минеральные Воды	42	59	-	148
Орёл			42	54	-	174
Ржев			42	60	-	140
Самара			42	53	69	-
Таганрог		42	54	-	169
Калининград		43	55	-	-
Кольчугино		43	63	-	133
Махачкала		43	55	73	-
Уфа			43	54	70	-
Шахты			43	55	-	168
Великие Луки		44	57	-	149
Ливны			44	62	-	134
Переславль-Залесский	44	68	-	131
Пермь			44	55	72	-
Узловая			44	61	-	136
Белая Калитва		45	66	-	132
Йошкар-Ола		45	57	-	171
Моршанск		45	67	-	130
Новочеркасск		45	58	-	161
Рыбинск			45	57	-	164
Тверь			45	56	-	-
Тихвин			45	61	-	138
Вязьма			46	62	-	136
Касимов			46	-	-	126
Киржач			46	-	-	124
Киров			46	-	-	127
Мурманск		46	58	-	176
Муром			46	59	-	152
Новосибирск		46	57	75	-
Петрозаводск		46	58	-	174
Скопин			46	-	-	123
Тюмень			46	58	80	-
Челябинск		46	58	75	-
Анапа			47	64	-	143
Богородицк		47	-	-	124
Ейск			47	61	-	146
Камышин			47	61	-	156
Кинешма			47	61	-	146
Красноярск		47	60	81	-
Омск			47	59	77	-
Оренбург		47	59	81	-
Саранск			47	59	-	177
Сергиев Посад		47	61	-	151
Сургут			47	60	-	-
Углич			47	-	-	126
Ульяновск		47	58	78	-
Ухта			47	61	-	154
Химки			47	60	-	169
Балаково		48	61	-	176
Балашов			48	62	-	145
Владикавказ		48	60	-	-
Гагарин			48	-	-	123
Данков			48	-	-	115
Дятьково		48	-	-	122
Ковров			48	60	-	158
Новошахтинск		48	62	-	152
Обнинск			48	61	-	150
Пущино			48	-	-	115
Рассказово		48	67	-	131
Рославль		48	64	-	135
Сафоново		48	66	-	131
Ярцево			48	65	-	132
Валуйки			49	-	-	126
Вязники			49	71	-	129
Губкин			49	63	-	147
Десногорск		49	-	-	122
Зарайск			49	-	-	118
Керчь			49	62	-	159
Лебедянь		49	-	-	115
Людиново		49	-	-	129
Миллерово		49	-	-	127
Мичуринск		49	63	-	149
Можайск			49	-	-	123
Мценск			49	69	-	130
Назрань			49	64	-	149
Нелидово		49	-	-	118
Нижнекамск		49	62	-	-
Нижний Ломов		49	-	-	116
Севастополь		49	61	-	-
Элиста			49	62	-	151
Волоколамск		50	-	-	117
Егорьевск		50	65	-	142
Кузнецк			50	65	-	151
Майкоп			50	63	-	160
Озёры			50	-	-	119
Петровск		50	-	-	124
Протвино		50	-	-	127
Ряжск			50	-	-	115
Урюпинск		50	-	-	130
Чайковский		50	64	-	150
Шуя			50	66	-	137
Ялта			50	65	-	147
Адлер			51	64	-	156
Арзамас			51	65	-	154
Армавир			51	64	-	170
Борисоглебск		51	66	-	140
Владивосток		51	64	94	-
Кисловодск		51	65	-	160
Коломна			51	65	-	163
Набережные Челны	51	64	-	-
Остров			51	-	-	115
Павловск		51	-	-	118
Пикалёво		51	-	-	115
Пятигорск		51	64	-	165
Россошь			51	67	-	140
Ростов Великий		51	-	-	122
Сальск			51	67	-	140
Серпухов		51	65	-	160
Старая Русса		51	-	-	123
Тольятти		51	63	84	-
Феодосия		51	66	-	143
Хабаровск		51	64	92	-
Юрьев-Польский		51	-	-	113
Алексеевка		52	-	-	128
Ахтубинск		52	-	-	134
Бокситогорск		52	-	-	109
Будённовск		52	68	-	142
Гуково			52	69	-	143
Кашин			52	-	-	111
Красный Сулин		52	-	-	130
Лодейное Поле		52	-	-	114
Михайловка		52	69	-	140
Морозовск		52	-	-	120
Новороссийск		52	65	-	177
Новый Уренгой		52	67	-	164
Осташков		52	-	-	115
Руза			52	-	-	105
Сарапул			52	66	-	155
Ступино			52	69	-	143
Томск			52	65	-	-
Богучар			53	-	-	102
Вичуга			53	-	-	127
Вольск			53	69	-	143
Выкса			53	71	-	139
Грозный			53	67	-	-
Грязи			53	73	-	133
Иркутск			53	66	-	-
Канаш			53	74	-	135
Козельск		53	-	-	111
Лабинск			53	70	-	142
Нальчик			53	66	-	178
Невинномысск		53	66	-	157
Новомичуринск		53	-	-	112
Орехово-Зуево		53	67	-	161
Барнаул			54	68	102	-
Ельня			54	-	-	98
Жирновск		54	-	-	110
Зверево			54	-	-	116
Кашира			54	-	-	131
Клинцы			54	72	-	143
Конаково		54	-	-	132
Кропоткин		54	69	-	149
Микунь			54	-	-	99
Михайлов		54	-	-	102
Обоянь			54	-	-	104
Семикаракорск		54	-	-	118
Сердобск		54	-	-	127
Суровикино		54	-	-	114
Сясьстрой		54	-	-	104
Белореченск		55	74	-	141
Валдай			55	-	-	108
Воткинск		55	71	-	161
Дзержинск		55	70	-	-
Железногорск		55	72	-	155
Калач-на-Дону		55	-	-	121
Кингисепп		55	74	-	135
Котово			55	-	-	119
Луга			55	-	-	127
Можга			55	77	-	140
Невель			55	-	-	108
Нижневартовск		55	68	-	-
Опочка			55	-	-	101
Орск			55	70	-	-
Таруса			55	-	-	97
Чаплыгин		55	-	-	102
Череповец		55	68	-	-
Южа			55	-	-	106
Апатиты			56	74	-	143
Благовещенск		56	-	-	143
Волжский		56	69	-	-
Выборг			56	72	-	152
Геленджик		56	74	-	140
Глазов			56	73	-	161
Ессентуки		56	71	-	158
Жердевка		56	-	-	107
Западная Двина		56	-	-	98
Ивангород		56	-	-	97
Ипатово			56	-	-	121
Калязин			56	-	-	106
Курган			56	70	-	-
Магадан			56	73	-	164
Павлово			56	73	-	142
Порхов			56	-	-	99
Суздаль			56	-	-	100
Сухиничи		56	-	-	109
Уварово			56	-	-	122
Усинск			56	-	-	137
Александров		57	75	-	145
Белинский		57	-	-	94
Зеленокумск		57	-	-	133
Кемерово		57	72	-	-
Кириши			57	76	-	143
Луховицы		57	-	-	126
Нефтекумск		57	-	-	124
Новоаннинский		57	-	-	112
Острогожск		57	-	-	130
Салехард		57	-	-	142
Светлоград		57	-	-	132
Сортавала		57	-	-	114
Сосенский		57	-	-	102
Сызрань			57	72	-	-
Темников		57	-	-	90
Ханты-Мансийск		57	75	-	166
Чудово			57	-	-	108
Благодарный		58	-	-	129
Велиж			58	-	-	91
Вышний Волочёк		58	78	-	141
Калининск		58	-	-	110
Кимры			58	77	-	139
Магнитогорск		58	74	-	-
Медынь			58	-	-	93
Навашино		58	-	-	111
Надым			58	-	-	143
Новохопёрск		58	-	-	88
Ноябрьск		58	74	-	168
Рузаевка		58	-	-	142
Спасск			58	-	-	90
Туапсе			58	75	-	146
Улан-Удэ		58	74	-	-
Южно-Сахалинск		58	74	-	-
Юхнов			58	-	-	90
Якутск			58	73	-	-
Бежецк			59	-	-	123
Бобров			59	-	-	116
Гаврилов Посад		59	-	-	87
Городовиковск		59	-	-	97
Гусь-Хрустальный	59	78	-	148
Евпатория		59	75	-	167
Задонск			59	-	-	97
Зубцов			59	-	-	90
Кирсанов		59	-	-	111
Новозыбков		59	-	-	139
Олонец			59	-	-	96
Петропавловск-Камчатский59	76	-	-
Сольцы			59	-	-	98
Харабали		59	-	-	114
Шацк			59	-	-	88
Бологое			60	-	-	123
Вытегра			60	-	-	100
Гороховец		60	-	-	107
Дорогобуж		60	-	-	100
Звенигород		60	-	-	112
Изобильный		60	-	-	139
Котлас			60	81	-	151
Краснослободск		60	-	-	111
Льгов			60	-	-	120
Новоалександровск	60	-	-	125
Новокузнецк		60	74	-	-
Окуловка		60	-	-	104
Пролетарск		60	-	-	118
Саров			60	77	-	163
Сасово			60	-	-	127
Спас-Клепики		60	-	-	85
Торжок			60	-	-	140
Унеча			60	-	-	125
Устюжна			60	-	-	97
Балабаново		61	-	-	127
Бутурлиновка		61	-	-	125
Верея			61	-	-	82
Каменка			61	-	-	138
Лазаревское		61	78	-	164
Новочебоксарск		61	79	-	179
Печоры			61	-	-	103
Себеж			61	-	-	87
Сергач			61	-	-	121
Сланцы			61	-	-	134
Азов			62	82	-	167
Аксай			62	-	-	143
Весьегонск		62	-	-	93
Воскресенск		62	83	-	173
Вятские Поляны		62	-	-	138
Демидов			62	-	-	91
Димитровград		62	79	-	175
Дно			62	-	-	96
Донской			62	85	-	160
Жиздра			62	-	-	84
Инсар			62	-	-	96
Ковылкино		62	-	-	123
Кулебаки		62	-	-	139
Лысково			62	-	-	122
Нижний Тагил		62	77	-	-
Питкяранта		62	-	-	103
Поворино		62	-	-	116
Серафимович		62	-	-	99
Судогда			62	-	-	104
Тутаев			62	-	-	142
Цимлянск		62	-	-	111
Чита			62	80	-	-
Шумерля			62	-	-	135
Абакан			63	81	-	-
Алатырь			63	-	-	142
Бузулук			63	85	-	171
Знаменск		63	-	-	133
Кизляр			63	-	-	148
Короча			63	-	-	85
Лиски			63	89	-	155
Малоярославец		63	-	-	135
Ртищево			63	-	-	144
Суджа			63	-	-	86
Тихорецк		63	86	-	158
Торопец			63	-	-	108
Березники		64	79	-	-
Вельск			64	-	-	127
Дербент			64	85	-	-
Нефтекамск		64	85	-	-
Норильск		64	83	-	-
Родники			64	-	-	132
Славянск-на-Кубани	64	88	-	160
Тобольск		64	81	-	172
Щигры			64	-	-	118
Агрыз			65	-	-	129
Братск			65	81	-	-
Волгореченск		65	-	-	117
Дмитров			65	91	-	164
Донецк			65	-	-	154
Кореновск		65	-	-	147
Коряжма			65	-	-	149
Кубинка			65	-	-	129
Лакинск			65	-	-	117
Миасс			65	82	-	-
Мирный			65	-	-	150
Нарьян-Мар		65	-	-	125
Петушки			65	-	-	116
Покров			65	-	-	120
Псебай			65	-	-	105
Пустошка		65	-	-	78
Пучеж			65	-	-	97
Сандово			65	-	-	92
Севск			65	-	-	93
Староминская		65	-	-	146
Стерлитамак		65	82	-	-
Темрюк			65	-	-	146
Фурманов		65	-	-	144
Бугульма		66	88	-	176
Воркута			66	91	-	170
Гдов			66	-	-	76
Зеленодольск		66	89	-	-
Златоуст		66	82	-	-
Малая Вишера		66	-	-	110
Медвежьегорск		66	-	-	115
Рудня			66	-	-	102
Старица			66	-	-	101
Удомля			66	-	-	134
Фатеж			66	-	-	84
Алушта			67	-	-	136
Альметьевск		67	85	-	-
Горячий Ключ		67	-	-	137
Духовщина		67	-	-	76
Инза			67	-	-	125
Каменногорск		67	-	-	92
Крымск			67	-	-	163
Кызыл			67	88	-	-
Мантурово		67	-	-	119
Моздок			67	-	-	144
Мосальск		67	-	-	75
Няндома			67	-	-	131
Почеп			67	-	-	125
Прохладный		67	96	-	162
Талдом			67	-	-	116
Тимашёвск		67	-	-	160
Анадырь			68	-	-	115
Волжск			68	-	-	167
Вуктыл			68	-	-	110
Георгиевск		68	93	-	172
Губаха			68	-	-	142
Клин			68	95	-	-
Костомукша		68	-	-	135
Кувшиново		68	-	-	107
Никольск		68	-	-	100
Павловский Посад	68	100	-	173
Печора			68	-	-	152
Усть-Лабинск		68	-	-	157
Шадринск		68	88	-	169
Шатура			68	-	-	145
Янаул			68	-	-	139
Алапаевск		69	-	-	152
Бежаницы		69	-	-	73
Дагомыс			69	97	-	179
Ершов			69	-	-	129
Кириллов		69	-	-	97
Когалым			69	-	-	161
Краснотурьинск		69	96	-	164
Курганинск		69	-	-	162
Курчатов		69	-	-	159
Нерюнгри		69	-	-	174
Новый Оскол		69	-	-	128
Реж			69	-	-	153
Рыбное			69	-	-	127
Серов			69	90	-	-
Фролово			69	-	-	153
Хоста			69	95	-	-
Цивильск		69	-	-	117
Бийск			70	87	-	-
Волхов			70	-	-	159
Данилов			70	-	-	122
Качканар		70	-	-	156
Красный Холм		70	-	-	89
Макарьев		70	-	-	95
Маркс 			70	-	-	144
Мегион			70	-	-	156
Невьянск		70	-	-	141
Нижняя Тура		70	-	-	139
Новосокольники		70	-	-	100
Починок			70	-	-	103
Снежинск		70	-	-	160
Суоярви			70	-	-	105
Сычёвка			70	-	-	100
Шарья			70	-	-	136
Ачинск			71	92	-	-
Домодедово		71	98	-	-
Кандалакша		71	-	-	153
Краснокамск		71	-	-	171
Кстово			71	-	-	178
Лахденпохья		71	-	-	100
Лоо			71	-	-	101
Максатиха		71	-	-	99
Оленегорск		71	-	-	137
Соликамск		71	93	-	-
Туймазы			71	105	-	177
Железнодорожный		72	100	-	-
Каменск-Уральский	72	93	-	-
Канск			72	94	-	-
Новокуйбышевск		72	99	-	-
Новопавловск		72	-	-	144
Нурлат			72	-	-	148
Рошаль			72	-	-	138
Сегежа			72	-	-	148
Сысерть			72	-	-	136
Тавда			72	-	-	150
Тейково			72	-	-	156
Аткарск			73	-	-	144
Бабаево			73	-	-	116
Барыш			73	-	-	131
Емва			73	-	-	124
Зеленогорск (ЗАТО)	73	105	-	175
Калач			73	-	-	136
Кировград		73	-	-	138
Котельнич		73	-	-	145
Лихославль		73	-	-	115
Нариманов		73	-	-	115
Наро-Фоминск		73	-	-	-
Нерехта			73	-	-	141
Очёр			73	-	-	127
Палласовка		73	-	-	126
Приволжск		73	-	-	130
Пыть-Ях			73	-	-	155
Саки			73	-	-	140
Салават			73	96	-	-
Сатка			73	-	-	159
Чистополь		73	-	-	175
Чусовой			73	-	-	161
Шахунья			73	-	-	138
Андреаполь		74	-	-	104
Буй			74	-	-	148
Верхний Тагил		74	-	-	122
Гаврилов-Ям		74	-	-	131
Дегтярск		74	-	-	129
Ирбит			74	-	-	155
Лабытнанги		74	-	-	149
Павловская		74	-	-	-
Североуральск		74	-	-	148
Удачный			74	-	-	123
Хвалынск		74	-	-	120
Кондрово		75	-	-	131
Онега			75	-	-	143
Сокол			75	-	-	164
Сухой Лог		75	-	-	155
Тотьма			75	-	-	111
Усть-Кут		75	-	-	174
Чебаркуль		75	-	-	162
Энгельс			75	101	-	-
Юрьевец			75	-	-	113
Аша			76	-	-	152
Баксан			76	-	-	160
Белоярский		76	-	-	138
Болгар			76	-	-	107
Дубна			76	-	-	-
Иловля			76	-	-	119
Карпинск		76	-	-	151
Кыштым			76	-	-	158
Лаишево			76	-	-	104
Нефтеюганск		76	100	-	-
Новоуральск		76	106	-	-
Северодвинск		76	108	-	-
Советский		76	-	-	149
Солнечногорск		76	-	-	-
Чернушка		76	-	-	153
Бавлы			77	-	-	142
Гатчина			77	117	-	-
Козьмодемьянск		77	-	-	146
Красноуфимск		77	-	-	-
Кумертау		77	-	-	-
Лесной			77	-	-	175
Минусинск		77	-	-	-
Назарово		77	-	-	173
Октябрьский		77	110	-	-
Первомайск		77	-	-	131
Саяногорск		77	-	-	172
Стародуб		77	-	-	141
Струнино		77	-	-	131
Тулун			77	-	-	174
Усмань			77	-	-	141
Хадыженск		77	-	-	144
Ардатов			78	-	-	115
Болхов			78	-	-	122
Бронницы		78	-	-	146
Верхняя Салда		78	-	-	168
Галич			78	-	-	138
Голицыно		78	-	-	139
Горнозаводск		78	-	-	123
Ишим			78	-	-	-
Касли			78	-	-	134
Красноармейск		78	-	-	153
Меленки			78	-	-	131
Нягань			78	-	-	178
Сураж			78	-	-	123
Талица			78	-	-	136
Щучье			78	-	-	121
Абинск			79	-	-	169
Горно-Алтайск		79	-	-	-
Губкинский		79	-	-	142
Далматово		79	-	-	128
Дальнегорск		79	-	-	164
Карталы			79	-	-	152
Катайск			79	-	-	132
Куса			79	-	-	139
Мглин			79	-	-	109
Николаевск		79	-	-	132
Первоуральск		79	108	-	-
Сосногорск		79	-	-	158
Уржум			79	-	-	119
Учалы			79	-	-	162
Александровск		80	-	-	130
Артёмовский		80	-	-	161
Балашиха		80	117	-	-
Белово			80	-	-	-
Боготол			80	-	-	147
Инта			80	-	-	167
Камешково		80	-	-	128
Камышлов		80	-	-	153
Котельниково		80	-	-	148
Красноуральск		80	-	-	151
Лысьва			80	-	-	-
Сорочинск		80	-	-	160
Троицк			80	-	-	-
Туринск			80	-	-	139
Чапаевск		80	-	-	-
Юрга			80	116	-	-
Абдулино		81	-	-	145
Заозёрный		81	-	-	126
Катав-Ивановск		81	-	-	138
Кунгур			81	-	-	-
Оса			81	-	-	146
Радужный		81	-	-	137
Рубцовск		81	108	-	-
Черноморское		81	-	-	125
Южно-Сухокумск		81	-	-	121
Южноуральск		81	-	-	167
Аркадак			82	-	-	132
Батайск			82	130	-	-
Белокуриха		82	-	-	140
Беслан			82	-	-	176
Верхний Уфалей		82	-	-	159
Верхняя Тура		82	-	-	119
Железноводск		82	-	-	159
Кизилюрт		82	-	-	176
Лениногорск		82	-	-	-
Урень			82	-	-	129
Боровичи		83	-	-	-
Бугуруслан		83	-	-	-
Дюртюли			83	-	-	170
Лесосибирск		83	-	-	-
Мамадыш			83	-	-	134
Новотроицк		83	-	-	-
Саянск			83	-	-	177
Судак			83	-	-	140
Хотьково		83	-	-	156
Шумиха			83	-	-	140
Бородино		84	-	-	143
Дивногорск		84	-	-	161
Кемь			84	-	-	131
Комсомольск		84	-	-	116
Кувандык		84	-	-	166
Любим			84	-	-	95
Хасавюрт		84	132	-	-
Большой Камень (ЗАТО)	85	-	-	174
Колпино			85	135	-	-
Комсомольск-на-Амуре	85	117	-	-
Новомихайловский	85	-	-	127
Пласт			85	-	-	141
Тайшет			85	-	-	172
Харовск			85	-	-	122
Анжеро-Судженск		86	-	-	-
Карабаш			86	-	-	134
Кондопога		86	-	-	179
Лангепас		86	-	-	-
Нижние Серги		86	-	-	128
Полярные Зори		86	-	-	142
Тында			86	-	-	178
Шушенское		86	-	-	145
Ангарск			87	117	-	-
Жигулёвск		87	-	-	-
Ивдель			87	-	-	147
Кодинск			87	-	-	140
Мелеуз			87	-	-	-
Пыталово		87	-	-	99
Сим			87	-	-	137
Уссурийск		87	126	-	-
Шарыпово		87	-	-	176
Асбест			88	-	-	-
Беломорск		88	-	-	129
Дмитриев-Льговский	88	-	-	114
Заволжск		88	-	-	133
Лукоянов		88	-	-	144
Майский			88	-	-	174
Михайловск		88	-	-	122
Находка			88	131	-	-
Новая Ляля		88	-	-	133
Новоузенск		88	-	-	149
Пестово			88	-	-	148
Подпорожье		88	-	-	156
Тара			88	-	-	163
Ужур			88	-	-	144
Югорск			88	-	-	179
Белозерск		89	-	-	124
Кугеси			89	-	-	137
Ленинск-Кузнецкий	89	-	-	-
Богданович		90	-	-	179
Гудермес		90	-	-	-
Енисейск		90	-	-	153
Кавалерово		90	-	-	140
Подольск		90	148	-	-
Славгород		90	-	-	174
Стрежевой		90	-	-	-
Усть-Катав		90	-	-	161
Барабинск		91	-	-	175
Белогорск		91	-	-	-
Верещагино		91	-	-	170
Верхнеуральск		91	-	-	124
Дубовка			91	-	-	145
Заводоуковск		91	-	-	170
Усолье-Сибирское	91	-	-	-
Яранск			91	-	-	154
Азнакаево		92	-	-	-
Елабуга			92	-	-	-
Красный Кут		92	-	-	148
Куртамыш		92	-	-	149
Кушва			92	-	-	178
Менделеевск		92	-	-	168
Нея			92	-	-	129
Нижнеудинск		92	-	-	-
Петров Вал		92	-	-	140
Тюкалинск		92	-	-	134
Мензелинск		93	-	-	153
Мотыгино		93	-	-	104
Пушкино			93	-	-	-
Сибай			93	-	-	-
Уяр			93	-	-	139
Гулькевичи		94	-	-	-
Нязепетровск		94	-	-	138
Прокопьевск		94	143	-	-
Абаза			95	-	-	155
Заречный		95	-	-	-
Иланский		95	-	-	152
Кораблино		95	-	-	145
Крутинка		95	-	-	112
Мариинск		95	-	-	-
Пудож			95	-	-	129
Ревда			95	-	-	-
Сковородино		95	-	-	129
Чехов			95	-	-	-
Арсеньев		96	-	-	-
Бодайбо			96	-	-	150
Дальнереченск		96	-	-	178
Черногорск		96	-	-	-
Кизел			97	-	-	168
Коркино			97	-	-	-
Приобье			97	-	-	115
Тосно			97	-	-	-
Асино			98	-	-	179
Краснокаменск		98	-	-	-
Междуреченск		98	-	-	-
Ожерелье		98	-	-	137
Тайга			98	-	-	172
Трёхгорный		98	-	-	-
Грязовец		99	-	-	159
Еманжелинск		99	-	-	-
Ленск			99	-	-	174
Покачи			99	-	-	158
Алзамай			100	-	-	113
Ишимбай			100	-	-	-
Медногорск		100	-	-	-
Николаевск-на-Амуре	100	-	-	175
Юрюзань			100	-	-	144
Лесозаводск		101	-	-	-
Красновишерск		102	-	-	162
Отрадный		102	-	-	-
Перевоз			102	-	-	132
Горняк			103	-	-	147
Искитим			103	-	-	-
Колпашево		103	-	-	-
Свободный		103	-	-	-
Фокино (ЗАТО)		103	-	-	-
Кудымкар		104	-	-	-
Новоалтайск		104	-	-	-
Берёзово		105	-	-	112
Добрянка		105	-	-	-
Зима			105	-	-	-
Ноглики			105	-	-	135
Татарск			105	-	-	-
Гурьевск		106	-	-	147
Нытва			106	-	-	174
Алейск			107	-	-	-
Полевской		107	-	-	-
Северобайкальск		107	-	-	-
Биробиджан		109	-	-	-
Советская Гавань	109	-	-	-
Ялуторовск		109	-	-	-
Змеиногорск		110	-	-	140
Оха			110	-	-	-
Арамиль			111	-	-	160
Камень-на-Оби		111	-	-	-
Пугачёв			112	-	-	-
Яровое			114	-	-	172
Исилькуль		115	-	-	-
Волчанск		117	-	-	137
Славянка		117	-	-	-
Похвистнево		121	-	-	-
Партизанск		122	-	-	-
Семёнов			122	-	-	-
Спасск-Дальний		123	-	-	-
Усть-Илимск		123	-	-	-
Камбарка		124	-	-	144
Урай			125	-	-	-
Петровск-Забайкальский	131	-	-	-
Белорецк		133	-	-	-
Киселёвск		133	-	-	-
Бердск			134	-	-	-
Балей			135	-	-	155
Бикин			136	-	-	-
Железногорск-Илимский	141	-	-	-
Вихоревка		156	-	-	-
Шимановск		163	-	-	-
Бор			168	-	-	-
Борзя			172	-	-	-
Шахтерск		173	-	-	-

В модели также есть Алдан, Аргун, Арск, Артышта, Артём, Артёмовск, Аян, Бабушкин, Багдарин, Байкальск, Байкит, Батагай, Белая Гора, Белый, Берёзовый, Богородское, Болотное, Буинск, Ванавара, Ванино, Великий Устюг, Верхневилюйск, Верхотурье, Вилюйск, Вяземский, Гремячинск, Гусиноозёрск, Давлеканово, Депутатский, Диксон, Долинск, Ербогачён, Жиганск, Жуковка, Забайкальск, Завитинск, Заинск, Залахтовье, Заринск, Злынка, Зуевка, Зырянка, Игарка, Игрим, Избербаш, Изборск, Известковый, Казачинское, Калачинск, Калевала, Карагайский, Карасук, Карачев, Каргасок, Каргат, Кепервеем, Кинель, Киренск, Кола, Кослан, Красный Чикой, Купино, Курильск, Ленинск, Лобня, Луза, Любань, Макаров, Макушино, Малоархангельск, Мама, Манжерок, Мещовск, Миньяр, Могоча, Мураши, Мыски, Мытищи, Называевск, Нарткала, Нижнеангарск, Новоабзаково, Новоржев, Новосиль, Нюрба, Облучье, Обь, Озеро-Карачинское, Озёрск, Оленёк, Олёкминск, Омолон, Омсукчан, Охотск, Павелец, Певек, Пено, Петухово, Плёс, Поронайск, Пржевальское, Пряжа, Саккырыр, Салми, Саскылах, Светлогорск (Красноярск.), Северо-Енисейский, Сеймчан, Симеиз, Синяя Осока, Слюдянка, Соль-Илецк, Сонково, Сорск, Сосновка, Спас-Деменск, Среднеколымск, Сретенск, Сунтар, Сусуман, Таксимо, Талакан, Терек, Тикси, Тогучин, Толька, Томмот, Топки, Тура, Туран, Туруханск, Усть-Качка, Усть-Кокса, Усть-Куйга, Усть-Нера, Усть-Цильма, Хандыга, Хатанга, Хилок, Холм, Хонуу, Хотынец, Чара, Чемал, Черемхово, Черепаново, Чернолучье, Черский, Чокурдах, Чулым, Чумикан, Чёрмоз, Шилка, Эвенск, Южно-Курильск — эти города либо заражаются позднее моделируемого периода, либо не набирают 1000 инфицированных.

Сценарий 2

Самый «изолированный» сценарий. В нём остаются только 10% от трафика перевозок, то есть попадать из одной точки в другую становится куда тяжелее, но возможно. Это не полный карантин, а существенное снижение связности. Люди внутри городов не ходят на ярмарки и стараются самоизолироваться, но делают это не идеально, а в меру своего понимания. Моделируется период в 180 дней (соответственно, Барнаул, набравший тысячу больных на 174-й день модели не успеет набрать меньше тысячи больных в процессе «придавливания» эпидемии). Города, которых нет в таблице, не набирают больше 1000 больных или не заражаются.

Город			>1000	>10.000	>100.000 <1000
Москва			18	33	51	-
Ижевск			40	60	-	-
Киров			42	-	-	158
Нижний Новгород		45	66	-	-
Архангельск		46	68	-	-
Брянск			46	67	-	-
Санкт-Петербург		46	62	88	-
Ростов-на-Дону		56	76	-	-
Сыктывкар		61	91	-	-
Воронеж			62	86	-	-
Ярославль		63	88	-	-
Переславль-Залесский	65	-	-	172
Рязань			65	91	-	-
Пенза			66	94	-	-
Тула			66	93	-	-
Симферополь (Крым)	68	99	-	-
Алексин			69	-	-	-
Калуга			69	108	-	-
Киржач			69	-	-	160
Белгород		70	103	-	-
Казань			70	103	-	-
Липецк			70	104	-	-
Иваново			71	105	-	-
Краснодар		71	104	-	-
Саратов			71	105	-	-
Астрахань		72	109	-	-
Каменск-Шахтинский	72	-	-	-
Смоленск		72	110	-	-
Сочи			72	109	-	-
Тамбов			72	112	-	-
Волгоград		73	108	-	-
Елец			73	-	-	-
Ставрополь		74	113	-	-
Владимир		75	118	-	-
Ржев			75	-	-	-
Кольчугино		77	-	-	-
Минеральные Воды	77	-	-	-
Чебоксары		77	128	-	-
Старый Оскол		78	-	-	-
Волгодонск		80	-	-	-
Курск			81	-	-	-
Таганрог		81	-	-	-
Узловая			81	-	-	-
Ливны			82	-	-	-
Моршанск		82	-	-	-
Орёл			82	-	-	-
Екатеринбург		83	166	-	-
Скопин			83	-	-	168
Вологда			84	-	-	-
Касимов			84	-	-	173
Кострома		84	-	-	-
Пущино			84	-	-	149
Самара			84	178	-	-
Белая Калитва		85	-	-	-
Нелидово		85	-	-	157
Псков			85	-	-	-
Уфа			85	-	-	-
Великие Луки		86	-	-	-
Махачкала		86	-	-	-
Шахты			86	-	-	-
Калининград		87	-	-	-
Богородицк		88	-	-	175
Пермь			89	-	-	-
Данков			90	-	-	155
Йошкар-Ола		90	-	-	-
Вязьма			91	-	-	-
Новочеркасск		91	-	-	-
Кашин			92	-	-	141
Рыбинск			92	-	-	-
Таруса			92	-	-	117
Углич			92	-	-	-
Нижний Ломов		93	-	-	160
Дятьково		94	-	-	175
Михайлов		94	-	-	126
Муром			94	-	-	-
Новгород Великий	94	-	-	-
Новосибирск		94	-	-	-
Осташков		94	-	-	147
Тюмень			94	-	-	-
Лебедянь		95	-	-	157
Мурманск		96	-	-	-
Саранск			96	-	-	-
Челябинск		96	-	-	-
Анапа			97	-	-	-
Кинешма			97	-	-	-
Ульяновск		97	-	-	-
Валуйки			98	-	-	-
Гагарин			98	-	-	-
Десногорск		98	-	-	178
Ейск			98	-	-	-
Балашов			99	-	-	-
Зарайск			99	-	-	167
Камышин			99	-	-	-
Красноярск		99	-	-	-
Можайск			99	-	-	-
Обнинск			99	-	-	-
Омск			99	-	-	-
Рославль		99	-	-	-
Руза			99	-	-	135
Химки			99	-	-	-
Оренбург		100	-	-	-
Рассказово		100	-	-	-
Сафоново		100	-	-	-
Сургут			100	-	-	-
Балаково		101	-	-	-
Людиново		101	-	-	-
Озёры			102	-	-	171
Ухта			102	-	-	-
Владикавказ		103	-	-	-
Ряжск			103	-	-	161
Ярцево			103	-	-	-
Богучар			104	-	-	128
Вязники			104	-	-	-
Губкин			104	-	-	-
Ковров			104	-	-	-
Миллерово		104	-	-	-
Тихвин			104	-	-	-
Волоколамск		105	-	-	165
Мценск			105	-	-	-
Сергиев Посад		105	-	-	-
Элиста			105	-	-	-
Юрьев-Польский		105	-	-	154
Новошахтинск		107	-	-	-
Петровск		107	-	-	-
Шуя			107	-	-	-
Мичуринск		108	-	-	-
Тверь			108	-	-	-
Назрань			109	-	-	-
Протвино		110	-	-	-
Егорьевск		111	-	-	-
Керчь			111	-	-	-
Урюпинск		111	-	-	-
Нижнекамск		112	-	-	-
Кузнецк			113	-	-	-
Павловск		113	-	-	169
Петрозаводск		114	-	-	-
Ростов Великий		114	-	-	-
Майкоп			116	-	-	-
Россошь			117	-	-	-
Борисоглебск		118	-	-	-
Коломна			118	-	-	-
Хабаровск		118	-	-	-
Владивосток		119	-	-	-
Серпухов		119	-	-	-
Морозовск		120	-	-	174
Арзамас			122	-	-	-
Чайковский		124	-	-	-
Армавир			125	-	-	-
Михайловка		126	-	-	-
Томск			126	-	-	-
Красный Сулин		127	-	-	-
Ялта			127	-	-	-
Алексеевка		128	-	-	-
Ахтубинск		128	-	-	-
Севастополь		128	-	-	-
Феодосия		129	-	-	-
Кисловодск		130	-	-	-
Гуково			131	-	-	-
Ступино			131	-	-	-
Будённовск		133	-	-	-
Новый Уренгой		133	-	-	-
Иркутск			135	-	-	-
Пятигорск		135	-	-	-
Орехово-Зуево		137	-	-	-
Выкса			141	-	-	-
Сальск			141	-	-	-
Вольск			145	-	-	-
Тольятти		148	-	-	-
Грязи			150	-	-	-
Канаш			151	-	-	-
Грозный			157	-	-	-
Конаково		161	-	-	176
Адлер			164	-	-	-
Сарапул			164	-	-	-
Набережные Челны	173	-	-	-
Барнаул			174	-	-	-

Я ещё раз напомню, что это моделирование распространения инфекции между городами, а не учёт смертности и остального. Вы можете помочь ODS, написав в личку mephistopheies.

Ещё важное: центр в Сколтехе решил выделить вычислительное время на суперкомпьютере Zhores для моделирования задач, так или иначе связанных со сдерживанием эпидемии. У них есть CPU-ноды (небольшая часть, но есть) и GPU-ноды (в нодах стоят по 4 Tesla P100). Если у вас есть распараллеленный под MPI CPU код или необходимость посчитать модели в параллельном режиме на GPU — подходит. Можно приносить любые задачи, которые как-нибудь связаны с борьбой с эпидемией, например по молекулярному моделированию, моделированию транспортных потоков и т.п. Контакты: sergey.sosnin@skoltech.ru или можно подать заявку напрямую.

Что это значит?

Российская логистика — одна из самых сложных в мире. У нас очень много изолированных городов, население значительно раскидано по планете, огромные пустые территории. Из плотносвязанного на западе граф превращается в слабосвязанный на востоке.

Это может означать, что можно отрезать существенные части графа от основных очагов (но, похоже, уже поздно из-за возвращавшихся в разные крупные города из-за границы).

Модели без учёта такого распространения очень сильно ограничены отсутствием нужных данных.

Сейчас фактор неравномерности населения означает, что можно резко переменить ход развития эпидемии, перекрывая транспортное сообщение.

Главный коммерческий вывод — возможно, локдаун сейчас дешевле, чем последствия дальше.

Я приглашаю вас не верить мне на слово, а расколупать модель, поковыряться в CSV и коде, докрутить и улучшить результат, который предоставило ODS. Собственно, сейчас сообщество работает над уточнениями модели.

И особо отмечу, что тот факт, что сообщество взялось за проект, сделало его и открывает результат — это огромный прецедент в пользу того, что сами данные нужно открывать. Потому что иногда они крайне полезны, даже если у вас нет времени или возможности с ними что-то сделать.

Ссылки в одном месте, большой пост с кучей ссылок на разные исследования, mephistopheies — ваш вход в ODS, если вы хотите помочь.

Автор: Сергей Абдульманов

Источник


* - обязательные к заполнению поля


https://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/3.4.1/jquery.min.js