Рубрика «биоинформатика» - 11

в 20:45, , рубрики: 23andme, SNP, биоинформатика, Биотехнологии, метки: ,

Смертельная болезнь оказалась программным багом 23andMeУ немецкого программиста Лукаса Хартманна (Lukas F. Hartmann) недавно случился второй день рождения. Он узнал, что диагностированная у него по результатам генетического теста смертельная болезнь — всего лишь баг программы. В смысле, не его генетической программы, а компьютерной программы статистического анализа генетической информации.

23andMe — частная биотехнологическая компания из США, которая осуществляет изучение генома всего за $99. Человек должен отправить в фирму капельку слюны, а в ответ получит логин и пароль для доступа к результатам анализа (предупреждение: отправка генетического материала из России запрещена законодательством РФ, поэтому фирма 23andMe не принимает образцы из России).
Читать полностью »

в 8:46, , рубрики: java, scss, Алгоритмы, биоинформатика, сжатие данных, строки, метки: , , , , ,

Проблема кратчайшей общей надстроки формулируется следующим образом: найти кратчайшую строку, такую, что каждая строка из заданного набора являлась бы её подстрокой. Эта проблема имеет место как в биоинформатике (задача сборки генома в общем случае) так и в сжатии данных (вместо данных хранить их надстроку и последовательность пар, вида (индекс вхождения, длина)).

Когда я искал в сети информацию по этой проблеме и её решению на русском языке — находилась лишь пара постов про биоинформатике, где вскользь упоминаются эти слова. Кода (кроме жадного алгоритма), конечно же, тоже не было. Разобравшись в проблеме, этот факт сподвиг на статью здесь.

Осторожно, 4 мегабайта!
Читать полностью »

в 8:23, , рубрики: биоинформатика, биология, Блог компании ПостНаука, будущее, генетика, ПостНаука, метки: , , , ,

Продолжая ездить по лабораториям и смотреть, как идут в будущее отечественные ученые, мы заглянули к микробиологу, генетику, Константину Северинову, и он поведал нам о том, какие сейчас наиболее активные течения в биологии, какие вскоре понадобятся ученые в этой области и какого рода задачи они будут решать.
ScienceHub #03: Синтетическая микробиологияЧитать полностью »

в 6:42, , рубрики: биоинформатика, видео, генетические алгоритмы, лекция, ненормальное программирование, эволюция, метки: , , ,

Позвали прочитать открытую лекцию в алматинскую «Ракетную фирму». Ограничений в темах не было, поэтому я решил в очередной раз попробовать рассказать про эволюцию и генетические алгоритмы.

Почему верить в эволюцию – глупо, почему эволюция это не «всего лишь теория», где же все связующие звенья среди ископаемых, почему мы не происходили от обезьян и как работают генетические алгоритмы.

P.S. Лекция записывалась на камеру (полную версию в не очень хорошем качестве можно посмотреть здесьЧитать полностью »

в 10:39, , рубрики: биоинформатика, биология, Биотехнологии, материалы, Мероприятия, образование, программирования, Учебный процесс в IT, школы, метки: , , , , , ,

Этим летом в Москве прошла первая летняя школа по биоинформатике. В ней приняло участие более 100 человек, которые приехали из различных уголков России и СНГ и были разделены на два потока: «информатики» и «биологи». Организовал мероприятие Институт биоинформатики в сотрудничестве с СПбАУ РАН, МГУ, ИППИ РАН и программой GameChangers.

Про то, как прошла сама школа, на хабре уже писали наши студенты. Теперь же каждый желающий, не имевший возможности поучаствовать в школе, может ознакомиться с интересующими его докладами: мы выложили все видеозаписи лекций и все слайды презентаций онлайн.

Если вы впервые слышите про биоинформатику, то советую в первую очередь посмотреть вводную лекцию Аллы Лапидус, которая расставит всё на свои места. Сейчас Алла занимает ведущие позиции в центре геномной биоинформатики СПбГУ и в лаборатории алгоритмической биологии СПбАУ РАН, а ранее долгое время руководила геномными проектами в DOE Joint Genome Institute (Калифорния).

Материалы летней школы по биоинформатике

Под катом можно посмотреть список всех прошедших лекций, включая их краткие описания, которые помогут вам сориентироваться, а также полные видеозаписи на русском.Читать полностью »

в 7:07, , рубрики: coursera, stepic, Алгоритмы, биоинформатика, Биотехнологии, образование, онлайн-курсы, Учебный процесс в IT, метки: , , , , ,

Алгоритмы в биоинформатике, онлайн курсСеквенирование генома человека десять лет назад явилось причиной вычислительной революции в биологии. Оно стало стимулом для создания бо́льшего числа новых алгоритмов, чем в любой другой фундаментальной области науки.

21 октября мы с Филлипом Компо и Павлом Певзнером из Университета Калифорнии запускаем онлайн-курс по алгоритмам в биоинформатике на Coursera. Уже до 21 октября можно посмотреть содержание первой главы курса и порешать задачи на нашем новом образовательном проекте Stepic, над которым работает команда широко известного в узких (биоинформатических) кругах проекта Розалинд.Читать полностью »

в 6:52, , рубрики: Human Brain Project, биоинформатика, Биотехнологии, будущее здесь, нейробиология, нейроморфный чип, симуляция мозга, метки: , , ,

Проект «Человеческий мозг» официально стартовал

7 октября в Швейцарии состоялся съезд 135 исследователей из стран, которые участвуют в международном проекте Human Brain Project. С бюджетом в €1,19 млрд он рассчитан на десять лет и является самым крупным и амбициозным проектом по симуляции человеческого мозга.
Читать полностью »

в 13:34, , рубрики: autodesk, CAD/CAM, Анимация и 3D графика, биоинформатика, биопечать, Биотехнологии, ненормальное программирование, метки: , , , ,

image
Карлос Олгуин (Carlos Olguin) — руководитель исследований в области био/нано/программируемого вещества в R&D подразделении Autodesk. Его группа в составе 18 специалистов изучает возможности проектирования, связанные с программированием вещества, в разных областях и в разных масштабах, сотрудничая с исследователями из ведущих научных учреждений и коммерческих компаний со всего мира. В преддверии приезда Карлоса на Autodesk University Russia мне удалось задать ему несколько вопросов о его работе
Читать полностью »

в 10:08, , рубрики: 239, биоинформатика, лекториум, нанотехнологии, образование, робототехника, метки: , , ,

image

Скоро стартует набор в кружки знаменитой школы 239 (Санкт-Петербург). Для детей Питера и ЛО, с 6 по 11 класса. Все занятия бесплатные и проводятся ведущими преподавателями в своей области.

Уверен,ам будут интересны следующие направленности:
Математический центр
Робототехнический центр
It направление
Нанотехнологии (да, в 239 есть своя нанолаборатория)

Читать полностью »

в 10:06, , рубрики: QSAR, биоинформатика, лекарства, хемоинформатика

Компании-разработчики лекарственных средств тратят большие деньги на исследования. Так, в таблице топ-бюджетов R&D все компании раздела «Healthcare» – фармацевтические компании, что занимаются поиском новых лекарств. Дело в том, что поиск лекарственного средства сродни поиску иголки в стоге сена. Ускорить этот поиск и сэкономить помогают информационные технологии. Роль ІТ при поиске новых лекарств частично освещена на Хабре статьями разделов «биоинформатика» и «биотехнологии», в том числе этой . Однако читателям представлен только подход со стороны биологии. Здесь же предлагается более полный обзор с учетом достижений со стороны химии. Если интересно – поехали!
Читать полностью »

1...101112...18
Главная   |  Архив новостей  |   Android  |   Google  |   Apple  |   Microsoft  |   Информационная безопасность  |   Веб – разработка
Публикации RSS  |  Комментарии RSS
https://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/3.4.1/jquery.min.js