Тест, призванный расширить границы возможностей секвенирования ДНК отдельных клеток, привёл к гораздо более удивительному открытию: микроскопический организм из пруда в парке Оксфордского университета, по-видимому, использует генетический код невиданным ранее способом.
Доктор Джейми Макгоуэн, научный сотрудник-постдокторант Института Эрлхэма, изучал геном протистаЧитать полностью »
Буквально лет 20 назад мир охватил нарратив, дескать мы используем только 10% своего мозга. И фильмы «Люси», «Области Тьмы» и даже «Ученик Чародея» активно использовали этот баг интерпретации. Но, точно также, существует мнение, что огромная часть нашей ДНК – это мусор, накопившийся как атавизм за годы эволюции. Что ж, новое исследование показывает, что часть этой «мусорной ДНК» буквально затащила наш мозг на вершину эволюции. И нас вместе с ним.
Перед вами перевод статьи о том, как прочитать свою ДНК дома. Автор разбирает бюджетный протокол MinION, типичные ошибки и мотивы эксперимента. Дальше слово автору.
Это руководство для инициативных и смелых энтузиастов, которые хотят узнать больше о своей биологии. Я расскажу, как секвенировал (читал) свой геном на кухонном столе: что для этого понадобилось, в чём смысл каждого из ключевых шагов и во сколько всё это в конечном итоге обошлось.
Стоимость одного прогона: ~$1100 (проточная ячейка + реагенты).
Работа руками: ~4 часа. Всего потрачено: ~72 часа.
Содержание:
Первое — это интерес, как двигатель узнать что-то новое. Это также напрямую связано с развитием ИИ, где я принимаю непосредственное участие.
И второе — если посмотреть, как реальная клетка читает мРНК и собирает белки, это похоже на исполнение байткода:
Рибосома движется по мРНК в одном направлении и читает её триплетами — по три нуклеотида за раз. Для программиста это похоже на последовательный разбор потока, где каждый следующий токен имеет фиксированную длину.
Старт-кодонЧитать полностью »
Как известно, ДНК служит хранилищем всей информации, необходимой клетке для развития, поддержания своего существования и выполнения своей функции. Около двух метров хроматина (ДНК в комплексе с белками – гистонами) лежит в ядре каждой клетки в конденсированном (чудовищно свернутом) виде – немудрено и запутаться. Было бы очень скучно, если бы это сокровище не нашло бы применения получше, чем просто какое-то там хранилище информации. И такое применение нашлось!
Считалось, что культура стала нашим надежным щитом от естественного отбора. Но 15 тысяч древних геномов доказывают обратное: когда мы распахали поля и построили города, наша ДНК включилась в яростную гонку на выживание.
Представьте мир, в котором Covid, ВИЧ, гепатит и герпес — это не болезни, а исторические факты из учебников. Мир, где сезонный грипп не валит с ног, а новые пандемии просто не могут начаться, потому что вирусам негде размножаться.
Расшифровав человеческий геном (им, кстати, был геном самого Джеймса Уотсона, одного из авторов модели двойной спирали ДНК), ученые недолго довольствовались результатом. Наука концентрировалась на больших генах, кодирующих крупные белки длиной в ~300 аминокислот, но обнаружилось, что такие гены занимают всего ~1–2% ДНК. Все остальное, по логике экономии объяснений, решено было считать «мусором» — junk DNA, накопившимся побочным продуктом эволюции.
